Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms