Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SEMA3FQ13275 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms