Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRIM28Q13263 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRIM28Q13263 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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