Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CBX3Q13185 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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