Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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