Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ACACAQ13085 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms