Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXF1Q12946 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF1Q12946 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF1Q12946 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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