Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPRDP23468 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRDP23468 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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