Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms