Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP25Q9UHP3 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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