Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP35Q9P2H5 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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