Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PHACTR1Q9C0D0 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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