Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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SPOCK3Q9BQ16 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SPOCK3Q9BQ16 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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