Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
IFNL1Q8IU54 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms