Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GEN1Q17RS7 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms