Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SGCBQ16585 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SGCBQ16585 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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