Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHHQ15465 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHHQ15465 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHHQ15465 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHHQ15465 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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