Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms