Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PTPRKQ15262 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
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PTPRKQ15262 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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PTPRKQ15262 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRKQ15262 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRKQ15262 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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