Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms