Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
BECN1Q14457 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BECN1Q14457 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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