Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
COL4A6Q14031 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms