Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ALCAMQ13740 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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