Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
RAPSNQ13702 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RAPSNQ13702 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167 ms