Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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TOP3AQ13472 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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