Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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