Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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TCOF1Q13428 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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TCOF1Q13428 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
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