Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CLN3Q13286 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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