Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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