Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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