Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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IFT88Q13099 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
IFT88Q13099 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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