Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK2Q13002 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GRIK2Q13002 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms