Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
USP18Q9UMW8 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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USP18Q9UMW8 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
USP18Q9UMW8 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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