Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
COPS7AQ9UBW8 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COPS7AQ9UBW8 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms