Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
UBXN4Q92575 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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