Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP6Q3SY56 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SP6Q3SY56 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SP6Q3SY56 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms