Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTL8BQ17RB0 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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RTL8BQ17RB0 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTL8BQ17RB0 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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