Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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HERC1Q15751 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERC1Q15751 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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