Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SS18Q15532 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms