Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SYCP1Q15431 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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