Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms