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| BRD3 | Q15059 | LINC01566-202 | ENST00000569242 | 2801 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.63 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC00907-209 | ENST00000593234 | 3376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | KCNQ5-IT1-201 | ENST00000445310 | 563 nt | TSL 2 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL9P32-201 | ENST00000464118 | 620 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC072039.1-201 | ENST00000477611 | 581 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC083800.1-201 | ENST00000490594 | 246 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP001025.2-201 | ENST00000490908 | 477 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | KLHL6-AS1-201 | ENST00000491676 | 503 nt | TSL 2 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC093278.1-201 | ENST00000494700 | 600 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | MTERF3-203 | ENST00000522822 | 1148 nt | TSL 2 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC002428.2-201 | ENST00000522973 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | KLRF2-201 | ENST00000535540 | 731 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02327-203 | ENST00000550122 | 738 nt | TSL 2 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00520-201 | ENST00000554186 | 831 nt | TSL 5 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL23AP87-202 | ENST00000573039 | 466 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC243829.5-201 | ENST00000578447 | 247 nt | TSL 5 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP001180.2-201 | ENST00000579413 | 422 nt | TSL 5 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC006254.3-201 | ENST00000603353 | 884 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | Metazoa_SRP.117-201 | ENST00000615106 | 292 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | NAA60-237 | ENST00000615865 | 326 nt | TSL 5 BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL590240.3-201 | ENST00000621416 | 943 nt | BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | C9orf72-203 | ENST00000380003 | 3200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MBNL1-211 | ENST00000463374 | 5092 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | OSBPL8-202 | ENST00000393249 | 7047 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.62 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ZNF43-207 | ENST00000595461 | 3399 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | CPHL1P-201 | ENST00000461341 | 3407 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC103591.2-201 | ENST00000265259 | 766 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL672167.1-206 | ENST00000356293 | 943 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-97P-201 | ENST00000363387 | 104 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-359P-201 | ENST00000365466 | 108 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
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| BRD3 | Q15059 | BEND7P1-201 | ENST00000422058 | 457 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | RBMY1KP-201 | ENST00000423480 | 476 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | MOBP-206 | ENST00000428261 | 561 nt | APPRIS ALT2 TSL 4 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL590302.1-201 | ENST00000431017 | 359 nt | TSL 2 BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |