Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SHPRHQ149N8 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SHPRHQ149N8 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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