Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXE3Q13461 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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FOXE3Q13461 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXE3Q13461 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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