Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
TCOF1Q13428 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TCOF1Q13428 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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