Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1AQ13111 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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