Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXF1Q12946 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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FOXF1Q12946 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXF1Q12946 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXF1Q12946 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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FOXF1Q12946 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXF1Q12946 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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FOXF1Q12946 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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FOXF1Q12946 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
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FOXF1Q12946 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXF1Q12946 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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