Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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CNTN1Q12860 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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CNTN1Q12860 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CNTN1Q12860 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CNTN1Q12860 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNTN1Q12860 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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