Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PTPREP23469 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PTPREP23469 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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PTPREP23469 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PTPREP23469 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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