Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RFXAPO00287 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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