Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERVV-1B6SEH8 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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